《功能基因组学统计方法》
作者 王琳 李雷著
书号 ISBN 978-7-5037-7756-1
开本 16开
装帧 平装
出版时间 2016年5月
责任编辑 徐颖
定价 33元
内容简介
复杂疾病是在众多遗传因素和环境因素共同作用下发生的疾病，遗传模式非常复杂，复杂疾病的发病机理及其治疗的研究是一个非常重要的课题。本书详细阐述了解析复杂疾病分子机制的一些功能基因组学统计方法。全书共分为六章。第一章基因芯片数据的正规化，第二章基因表达数据的统计推断，第三章基因芯片数据分析的整体思路和框架，第四章[Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究简介，第五章[Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究中的基因芯片数据正规化，第六章[Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究中的统计推断。附录A 新型纳米粒子[Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究中的基因芯片数据正规化结果，附录B 术语词汇表。
针对基因芯片数据的正规化问题，本书阐述了作者提出的利用简单线性样条模型进行基因芯片子块正规化的方法，并介绍了作者提出的利用基因表达差异值的核密度估计图来评价正规化的效果的方法。在进行基因芯片数据的正规化之后，本书推荐使用Wilcoxon秩和得分检验方法进行基因富集分析，并阐述了作者提出的一种对转录因子的有效调控进行推断的方法，即BASE2.0方法。BASE2.0方法解决了原来的BASE方法中存在的由于正负表达差异数值尺度不一造成的数据淹没问题。最后，本书将利用简单线性样条模型进行基因芯片子块正规化的方法、Wilcoxon秩和得分检验方法和BASE2.0方法应用于新型纳米粒子[Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究的实际数据中，得到了很多有意义的生物发现。本书的研究结果为复杂疾病分子机制的研究提供了有效的工具和手段。
作者简介
王琳，首都经济贸易大学讲师，中国科学院数学与系统科学研究院概率论与数理统计博士毕业，研究方向主要是计算生物学和生物信息学。工作涉及统计建模、数据分析、算法开发、软件开发、生物结论分析等。2015年8月—2016年8月在美国匹兹堡大学做访问学者。
李雷，中国科学院数学与系统科学研究院研究员。1998年获得美国加州大学伯克利分校统计系博士学位；2000年秋季在加利福尼亚大学洛杉矶分校纯粹与应用数学研究所做博士后。2002-2010年在南加利福尼亚大学计算生物及数学系任教并于2005年获终身职务。2010年入选中国科学院“百人计划”。
